Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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FANCFQ9NPI8 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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FANCFQ9NPI8 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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FANCFQ9NPI8 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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FANCFQ9NPI8 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FANCFQ9NPI8 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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