Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 LINC00444-201ENST00000435617 215 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AC007790.1-201ENST00000439081 782 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL263P-201ENST00000467969 290 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL314P-201ENST00000490735 292 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 GAPDHP38-201ENST00000503632 1002 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AP001122.1-201ENST00000572256 541 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AP005131.5-201ENST00000585817 498 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 PRR13P3-201ENST00000603578 376 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 TRMT13-203ENST00000370143 476 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 ETF1P1-206ENST00000427296 984 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 CADM2-AS2-201ENST00000467225 768 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ANKRD42Q8N9B4 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms