Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP34Q70CQ2 OXCT1-205ENST00000510634 1441 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP34Q70CQ2 WNK1-204ENST00000530271 11804 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP34Q70CQ2 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP34Q70CQ2 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP34Q70CQ2 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP34Q70CQ2 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP34Q70CQ2 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP34Q70CQ2 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP34Q70CQ2 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP34Q70CQ2 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP34Q70CQ2 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP34Q70CQ2 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 EMC1-207ENST00000477853 6664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 ARPC5-202ENST00000359856 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 PIEZO2-202ENST00000383408 9718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 ASPA-201ENST00000263080 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 RBM7-204ENST00000541475 6725 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 OR4D9-202ENST00000641278 6063 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 PPP6R3-214ENST00000527403 4862 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 DROSHA-220ENST00000513349 4681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 FNDC3A-204ENST00000492622 6286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 EIF5B-201ENST00000289371 5777 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 PKD1-201ENST00000262304 14138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 PKD1-203ENST00000423118 14135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 KALRN-211ENST00000460856 6509 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 ZNF217-201ENST00000302342 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 LINC00654-201ENST00000379053 6113 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 ARHGEF11-201ENST00000361409 5788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP34Q70CQ2 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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