Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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CCDC96Q2M329 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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CCDC96Q2M329 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC96Q2M329 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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CCDC96Q2M329 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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CCDC96Q2M329 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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CCDC96Q2M329 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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CCDC96Q2M329 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC96Q2M329 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
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