Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 USP14-201ENST00000261601 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 SECISBP2L-209ENST00000559471 7176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 ASPA-201ENST00000263080 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 CELF2-204ENST00000417956 8044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 EDA-213ENST00000616899 4643 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 CHFR-201ENST00000266880 11133 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 ACACB-202ENST00000377848 9247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 ERG-201ENST00000288319 4919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 GPR161-208ENST00000537209 8256 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 COL4A6-210ENST00000621266 6627 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 NAV2-208ENST00000527559 11171 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC008937.3-201ENST00000606813 1700 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 SEL1L-201ENST00000336735 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 FAT1-201ENST00000441802 14786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 MDM2-202ENST00000258149 12633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 RNF41-201ENST00000345093 5596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 PTBP3-205ENST00000374257 7240 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AL353626.1-201ENST00000613429 507 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 ZNF471-202ENST00000591537 5859 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 FAM19A2-211ENST00000550003 2499 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 DISP2-201ENST00000267889 12614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 ZKSCAN1-205ENST00000535170 8758 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 JADE1-203ENST00000452328 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 SYNJ2-207ENST00000638626 7332 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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