Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AP003122.2-201ENST00000527332 486 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 MIR4664-201ENST00000583819 71 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC008759.2-201ENST00000585880 600 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 TBC1D19-205ENST00000511789 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 OR1K1-201ENST00000277309 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 NCR2-201ENST00000373083 1154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 OR7E91P-201ENST00000400027 866 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL050320.1-201ENST00000420044 446 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC105393.2-201ENST00000431911 549 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AP006193.1-201ENST00000440724 485 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AP001646.2-201ENST00000528645 1156 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC069234.3-201ENST00000544939 569 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 PCAT29-202ENST00000558941 545 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC018521.4-201ENST00000578239 531 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms