Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TAF1AQ15573 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms