Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
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