Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AP1G1-201ENST00000299980 6969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NFIXQ14938 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms