Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 MLIP-201ENST00000274897 1815 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 MYO5BP3-201ENST00000431872 1279 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 NPIPB6-201ENST00000532254 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.4 ms