Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
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CDH18Q13634 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
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