Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 CASP1P2-201ENST00000526830 1258 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
EIF4EBP1Q13541 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 C5orf63-201ENST00000296662 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms