Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LINC01704-201ENST00000414848 834 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC118470.1-201ENST00000419891 453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 GYG1P2-201ENST00000426437 1006 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AF274573.1-201ENST00000430535 494 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC083864.2-201ENST00000446024 482 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 PABPC1P10-201ENST00000464731 381 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RN7SL91P-201ENST00000469313 291 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 PCAT29-202ENST00000558941 545 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RN7SL311P-201ENST00000579858 306 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 IZUMO3-203ENST00000604921 743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL160396.1-201ENST00000637433 575 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 TTC33-207ENST00000637375 1824 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ADH4-212ENST00000629236 1974 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 FAM205C-201ENST00000340783 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 MYL1-201ENST00000341685 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 OR1N2-201ENST00000373688 1103 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 MLXIP-203ENST00000377037 805 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RPS21P1-201ENST00000434479 247 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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