Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms