Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CBX1P83916 RN7SL91P-201ENST00000469313 291 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CBX1P83916 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CBX1P83916 RN7SL182P-201ENST00000496499 300 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CBX1P83916 SSU72P6-201ENST00000532644 488 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CBX1P83916 KLRD1-210ENST00000543777 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CBX1P83916 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CBX1P83916 LINC01892-201ENST00000579141 507 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CBX1P83916 STARD6-204ENST00000584040 660 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CBX1P83916 ZNF397-211ENST00000592264 1104 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CBX1P83916 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CBX1P83916 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AC012640.3-201ENST00000607847 430 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CBX1P83916 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AC087893.2-201ENST00000623272 255 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CBX1P83916 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CBX1P83916 DLD-205ENST00000440410 1993 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CBX1P83916 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CBX1P83916 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CBX1P83916 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CBX1P83916 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CBX1P83916 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 SNORA30B-201ENST00000365319 129 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 RPL12P10-201ENST00000413498 498 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AL596451.1-201ENST00000419824 572 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 RBMY2JP-201ENST00000425544 1059 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AC105393.2-201ENST00000431911 549 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 ANXA2P2-201ENST00000435128 1020 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AC005517.1-201ENST00000452091 489 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AC097460.2-201ENST00000511857 741 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 pRNA.9-201ENST00000618609 89 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBX1P83916 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AL049869.1-201ENST00000556933 1402 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 OR5AU1-201ENST00000304418 1199 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AL390195.1-202ENST00000416099 723 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 PHBP4-201ENST00000437447 837 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AC013727.1-202ENST00000455716 580 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AC018475.1-201ENST00000478358 465 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AC226119.1-201ENST00000514073 682 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBX1P83916 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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