Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC116158.2-201ENST00000559544 553 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ACADSBP45954 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms