Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RNVU1-15-201ENST00000384476 165 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPREP23469 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPREP23469 SMIM2-201ENST00000400419 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPREP23469 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
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PTPREP23469 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPREP23469 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
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PTPREP23469 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AC007000.1-201ENST00000453064 794 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AC004692.1-201ENST00000455430 424 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPREP23469 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
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PTPREP23469 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPREP23469 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AC138035.1-203ENST00000604354 1066 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
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PTPREP23469 HGF-209ENST00000457544 2249 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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PTPREP23469 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PTPREP23469 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
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PTPREP23469 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AP001442.1-201ENST00000617755 659 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AC005383.1-201ENST00000622689 534 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AC110769.3-201ENST00000624567 1173 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
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