Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC130456.6-201ENST00000623745 765 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 FAM13C-216ENST00000618427 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 PPFIA2-201ENST00000333447 5517 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 PRELID1P2-201ENST00000407805 396 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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PTPRAP18433 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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PTPRAP18433 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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PTPRAP18433 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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PTPRAP18433 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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PTPRAP18433 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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PTPRAP18433 INTS7-202ENST00000366993 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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PTPRAP18433 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 ADH4-209ENST00000508393 2151 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 ENO1P4-201ENST00000416471 1785 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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