Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 MIR181C-201ENST00000384881 110 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 OR4F7P-201ENST00000402444 931 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 OR4F1P-201ENST00000405102 938 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AL591368.1-202ENST00000413050 548 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 TRBV30-201ENST00000417977 447 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 OR4F2P-201ENST00000424047 938 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 CHCHD4P5-201ENST00000436684 427 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 RPS10P3-201ENST00000439253 494 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC007879.2-201ENST00000454444 551 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 TRBV5-4-201ENST00000454561 544 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 LINC02530-201ENST00000457945 894 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC008026.1-201ENST00000460492 447 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 RPL34P22-201ENST00000468193 318 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 RN7SL516P-201ENST00000496127 297 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AMTN-202ENST00000504451 761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC023794.3-204ENST00000510754 236 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 IGLVI-70-201ENST00000523272 390 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC084361.1-201ENST00000537730 607 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 LINC00640-201ENST00000554409 498 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 DRAIC-206ENST00000559029 309 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC044860.3-201ENST00000559957 368 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 DSG1-AS1-204ENST00000581856 669 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 OR7E94P-202ENST00000601375 790 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AL023806.2-201ENST00000603042 263 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 RN7SL760P-201ENST00000607344 270 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 WFDC8-201ENST00000289953 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms