Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLDN25C9JDP6 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms