Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 PITRM1-AS1-201ENST00000430356 3998 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 PCDH9-202ENST00000377865 5709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 KLHL32-202ENST00000369261 3698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 DIS3L2-202ENST00000325385 3501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 LRRC37A11P-202ENST00000579258 3717 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 MXI1-203ENST00000361248 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC245177.1-201ENST00000375625 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC239585.1-201ENST00000375644 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 GABRB3-225ENST00000638099 2752 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 SLC8A1-206ENST00000406391 2814 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 NBPF25P-201ENST00000606775 2019 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 LY75-CD302-201ENST00000504764 5650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 WNK1-220ENST00000574564 1401 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 GUCY2F-201ENST00000218006 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 LINC00964-202ENST00000510897 3534 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 CASP10-201ENST00000272879 2073 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 CACNA1D-219ENST00000636938 6868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AAMDC-202ENST00000393427 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 RPL12P27-201ENST00000414870 496 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 YWHAZP3-201ENST00000415292 738 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 RPL36P1-201ENST00000419720 225 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 OR3B1P-201ENST00000437536 893 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC002553.1-201ENST00000442828 802 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL133480.2-201ENST00000456723 487 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL388P-201ENST00000498736 339 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC023886.1-201ENST00000506057 685 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC083902.1-201ENST00000508578 359 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 IGLVIV-59-201ENST00000520218 250 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 OR4N1P-201ENST00000554847 949 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC092868.1-201ENST00000557949 802 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 CYP4A44P-201ENST00000569984 154 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 USP2-AS1-205ENST00000578923 895 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL760P-201ENST00000607344 270 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 5S_rRNA.20-201ENST00000612104 118 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 SCARB2-211ENST00000638603 4284 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 YME1L1-203ENST00000376016 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 ARNT2-207ENST00000533983 6690 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC022150.4-201ENST00000598322 2848 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 CCDC66-203ENST00000394672 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AF121897.1-201ENST00000411867 3980 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 BTBD3-202ENST00000378226 4904 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 SYT2-202ENST00000367268 7598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC099753.1-201ENST00000634947 2118 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 NLK-201ENST00000407008 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB40-201ENST00000374651 8368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC073065.1-201ENST00000411678 2866 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 MYO1E-201ENST00000288235 8673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 HIPK1-208ENST00000426820 4112 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 SLC28A2-201ENST00000347644 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AASS-203ENST00000417368 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 ERVFRD-1-202ENST00000542862 3184 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 TIMM21-204ENST00000580087 2524 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 OR4D9-202ENST00000641278 6063 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 CLEC1B-202ENST00000348658 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 RPL12-201ENST00000361436 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP301-201ENST00000362537 121 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 GSTA10P-201ENST00000412182 576 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 FABP5P1-201ENST00000423401 411 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC090954.1-201ENST00000445502 361 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL133232.1-201ENST00000458293 483 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC234782.3-201ENST00000461229 433 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 FAM74A1-201ENST00000465257 623 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 LEMD1-208ENST00000495594 637 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC122710.2-201ENST00000506093 596 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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