Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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