Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
GTF3C6Q969F1 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms