Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AP3B1-201ENST00000255194 5838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 ARPP21-203ENST00000396482 2416 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 FANCM-202ENST00000542564 6167 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 ASPM-203ENST00000367409 10887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 LCT-201ENST00000264162 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 GOLGB1-209ENST00000614479 11115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 MXRA5Y-201ENST00000420610 8000 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 LMO3-204ENST00000354662 3574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 CC2D2A-202ENST00000424120 5249 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 KIAA1217-207ENST00000396445 5706 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 CYP27C1-201ENST00000335247 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 OTOG-203ENST00000399397 9948 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 CLNK-201ENST00000226951 5599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 ZNF286A-203ENST00000421016 5541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 POGZ-201ENST00000271715 6626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 RHOBTB1-202ENST00000357917 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AF131215.2-201ENST00000531549 1710 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 APELA-202ENST00000507152 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 WWC2-205ENST00000504005 5247 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 FRY-202ENST00000380250 10688 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 FRY-209ENST00000642040 10697 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LAMA3Q16787 MYOCD-203ENST00000425538 8466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
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