Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms