Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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