Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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ITGB3BPQ13352 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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ITGB3BPQ13352 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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ITGB3BPQ13352 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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ITGB3BPQ13352 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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