Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SRSF5Q13243 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms