Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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CHAF1AQ13111 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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CHAF1AQ13111 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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CHAF1AQ13111 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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CHAF1AQ13111 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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CHAF1AQ13111 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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CHAF1AQ13111 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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CHAF1AQ13111 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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CHAF1AQ13111 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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CHAF1AQ13111 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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CHAF1AQ13111 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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