Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AL357153.1-201ENST00000500016 2941 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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FOXF1Q12946 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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FOXF1Q12946 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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FOXF1Q12946 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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FOXF1Q12946 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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FOXF1Q12946 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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FOXF1Q12946 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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FOXF1Q12946 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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