Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 DSC3-202ENST00000434452 6978 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 TMCC1-203ENST00000432054 5631 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 LPP-208ENST00000448637 5835 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 NHLRC2-201ENST00000369301 11051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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