Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC116158.2-201ENST00000559544 553 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms