Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 RBMY2AP-201ENST00000445405 1157 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 RBMY2CP-201ENST00000448575 1157 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 RBMY2DP-202ENST00000448881 1157 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 RBMY2BP-202ENST00000451071 1156 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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