Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 C1S-203ENST00000402681 2522 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPC7-206ENST00000513104 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FREM3-201ENST00000329798 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNH1-209ENST00000639952 8075 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB37-204ENST00000427304 2300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PEX19-201ENST00000368072 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 STAU1-207ENST00000371856 3684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005041.1-201ENST00000517883 7033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SORBS2-231ENST00000449407 3049 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 APP-201ENST00000346798 3467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF300-201ENST00000274599 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF219-201ENST00000282003 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZEB2-217ENST00000470879 2648 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TSPEAR-AS2-201ENST00000330490 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LCN12-202ENST00000371633 579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV3-25-201ENST00000390305 380 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHV1-24-201ENST00000390610 411 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 UQCC1-209ENST00000397556 1284 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073316.2-201ENST00000414126 418 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004830.1-201ENST00000420449 285 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC053503.4-201ENST00000431827 224 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005730.1-201ENST00000434406 344 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHV4-31-201ENST00000438142 428 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.7 ms