Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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