Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP110-201ENST00000410146 285 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MICD-202ENST00000413248 813 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 HCG23-205ENST00000426643 610 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 EIF4A1P10-201ENST00000428832 1216 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC245036.2-201ENST00000433549 287 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL606752.1-201ENST00000435442 666 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ZBTB20-AS5-201ENST00000465249 622 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 HNRNPA1P20-201ENST00000484852 955 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 IGKV1-8-201ENST00000495489 398 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ARF1P3-201ENST00000520038 511 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC044839.1-201ENST00000532307 541 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 EIF4EBP1P1-201ENST00000557776 341 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC009117.3-201ENST00000568136 543 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 KCTD2-206ENST00000581589 993 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC119868.2-201ENST00000583991 432 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RN7SL377P-201ENST00000585039 278 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 TTN-AS1-218ENST00000586452 828 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC004221.1-201ENST00000592843 844 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 FAM122B-208ENST00000611027 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 pRNA.12-201ENST00000614353 90 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 pRNA.3-201ENST00000615048 90 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 HNRNPCL3-201ENST00000617807 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.76-201ENST00000619429 290 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL356095.2-201ENST00000624025 457 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 IFT88-201ENST00000319980 3091 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 SLC14A1-221ENST00000619403 3823 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 CPEB4-209ENST00000522336 1551 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 P2RY10-204ENST00000544091 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 CCNT2-202ENST00000295238 4491 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 DYNLRB1-201ENST00000300469 1464 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 HYKK-205ENST00000566332 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 HBE1-202ENST00000380237 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 IGLV1-51-201ENST00000390290 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms