Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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CCDC142Q17RM4 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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CCDC142Q17RM4 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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CCDC142Q17RM4 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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CCDC142Q17RM4 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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CCDC142Q17RM4 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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CCDC142Q17RM4 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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