Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC079248.1-201ENST00000427568 1546 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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SYCP1Q15431 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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