Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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COL4A6Q14031 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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COL4A6Q14031 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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COL4A6Q14031 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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COL4A6Q14031 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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COL4A6Q14031 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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COL4A6Q14031 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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COL4A6Q14031 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
COL4A6Q14031 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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