Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CBFBQ13951 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.1 ms