Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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