Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AL355306.2-203ENST00000635102 1025 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms