Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC009812.3-201ENST00000523871 3766 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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FOXF2Q12947 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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FOXF2Q12947 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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FOXF2Q12947 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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FOXF2Q12947 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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FOXF2Q12947 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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