Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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PGGT1BP53609 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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PGGT1BP53609 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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PGGT1BP53609 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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PGGT1BP53609 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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PGGT1BP53609 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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PGGT1BP53609 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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PGGT1BP53609 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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PGGT1BP53609 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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