Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RPL37-205ENST00000509877 637 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC00967-204ENST00000518412 271 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RBM7-208ENST00000545678 867 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 NR2F2-AS1-205ENST00000559505 1005 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 EEF1B2P1-201ENST00000567221 672 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC008635.1-201ENST00000600716 562 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC108451.2-201ENST00000603875 538 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC019080.4-201ENST00000606200 564 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CCL4L2-212ENST00000615418 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC239809.3-218ENST00000616018 1023 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 C1D-202ENST00000407324 1379 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RNU1-21P-201ENST00000363327 163 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 HMGB1P39-201ENST00000366304 880 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LELP1-201ENST00000368747 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 IGLJ2-201ENST00000390322 175 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RN7SKP89-201ENST00000410774 242 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC090617.1-201ENST00000413674 323 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms