Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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