Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 TRIM51HP-202ENST00000530412 1823 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC005899.3-201ENST00000580360 271 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 LRIG3-202ENST00000379141 3667 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 HSPD1P4-201ENST00000547203 1702 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 MSL3-206ENST00000380693 2377 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 LINC02324-201ENST00000531609 1442 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 PCDH15-226ENST00000613657 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 OR8H1-203ENST00000641600 2927 ntAPPRIS P2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 SLC9A9-201ENST00000316549 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RFXAPO00287 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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