Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL512430.4-201ENST00000603085 613 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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SH3BP4Q9P0V3 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC067942.1-201ENST00000488045 1493 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC245100.4-202ENST00000634638 1342 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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