Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 PAPPA-AS2-201ENST00000438048 1854 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 LINC01687-203ENST00000420255 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AL162231.2-201ENST00000434627 665 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 TUBBP11-201ENST00000472255 252 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 RPL5P15-201ENST00000475870 897 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RNFT2Q96EX2 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms