Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HERC6Q8IVU3 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms